Morgan, um brillhante cientista, estudava genética em drosófilas e em seus estudos notou que certas características não obedeciam as proporções de Mendel. E além de não respeitar as proporções elas obedeciam outras proporções não explicadas mas que eram constantes.  Procurando respostas na citologia, Morgan atribuiu estas diferenças à formação dos quiasmas que ocorrem no crossing over durante a prófase I da meiose, alegando os cromossomos duplicados não  homólogos (em alguns casos homólogos também) trocavam material genético entre si.Com isso Morgan pode estabelecer a seguinte relação: quando a proporção de Mendel no cruzamentos é preservada, os genes estão em cromossomos separados, pois a segregação ocorre de forma independente, porém quando quando esta proporção não é respeitada os genes podem estar no mesmo cromossomo e não é só isso, ele conseguiu ainda estabelecer uma relação matemática com relação à taxa de frequência com que as cromátides podem se recombinar.
Pra ficar mais simples, se cruzarmos um indivíduo  

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